С 1968 г. и поныне в Коргалжинский заповедник входят только озера Тенгиз и Коргалжин с небольшой двухкилометровой зоной вокруг них, уникальные степи остались вне его охраны. В 1974 г. этот заповедник был включен в Рамсаарский список по категории А. Коргалжинский заповедник в современных границах занимает около 2,6 тыс кв.км самой низкой части Тенгиз-Коргалжинской впадины, куда стекают основные реки между Казахским мелкосопочником и Кокчетавской возвышенностью. 

Климат. Климат района резко континентальный с продолжительной холодной зимой и жарким сухим летом. Годовая амплитуда температур: +44°С в июле, до -49°С в январе. Снег ложится в конце октября, тогда же замерзают и озера, а сходит не раньше середины апреля. 

Озера Тенгиз, что по-казахски означает море, занимает самую низкую часть впадины. В годы максимального наполнения размер зеркала воды достигает более 1.5 тыс. кв. км, а наиболее глубокие места – 8 м. В годы с низким уровнем воды размер озера уменьшается на 70%, а максимальные глубины составляют всего 1.5-2 м. Однако в среднем длина его около 75 км, ширина 32 км.

Флора заповедника. Во флоре заповедника 350 видов растений, большую часть которых составляет травы. Здесь отмечено лишь около 15 видов кустарника, которые встречаются преимущественно в пойменных зарослях рек – это кустарниковые ивы, шиповники, жимолость. Казахстанскую степь невозможно представить себе без стелящегося под ветром седого ковыля, а запах жусана (полыни) по древней легенде был таким близким и родным для жителей этой земли, что казахские воины решили вернуться в родную степь из более благодатных земель. На территории заповедника отмечены 45 видов редких и эндемичных растений, требующих особой охраны. Это эндемик казахстанской степи – астрагал казахстанский, реликтовые – кубышка желтая, кувшинка чисто-белая, селитрянка Шобера. В Красную книгу Казахстана внесены тюльпан Шренка, тюльпан поникающий, прострелы – желтоватый и раскрытый. 

Фауна заповедника. Животный мир заповедника очень богат. В озерах развивается зоопланктон (мелкие беспозвоночные, живущие в толще воды) и зообентос (обитающие в природном слое). Среди них различные мелкие рачки (артемия, дафния), личинки насекомых, таких как комары-звонцы, стрекозы, различный гнус и другие. Самыми заметными здесь остаются птицы, ведь заповедник и создавался как орнитологический. К настоящему моменту отмечено более 300 видов птиц. Количество их, особенно во время миграций, поражает воображение даже опытных орнитологов. Кроме того, в степях заповедника гнездятся другие редкие птицы: журавль-красавка, стрепет, иногда дрофа. Всего в заповеднике зарегистрировано 20видов, внесенных в Международную красную книгу МСОП, 37 – в Красную книгу Казахстана. 

Фламинго – символ заповедника. Фламинго переводится с латинского «пламя».

Фламинго. Phoenicopterus

Фламинго – символ заповедника Коргалжын. Фламинго переводится с латинского «пламя». (лат. Phoenicopterus) — род птиц, единственный в семействе Фламинговые (Phoenicopteridae) и в отряде Фламинго образные (Phoenicopteriformes).Фламинго – чрезвычайно красивая и необычная птица: высотой почти в человеческий рост (известны экземпляры до полутораметров), однако весит при этом около 4 кг, с длинными ногами и такой же длинной шеей. Оперение у нее розоватое, а когда она расправляет крылья, видны черные концы крыльев и красный покров на них. Взлетающая птица словно вспыхивает огнем, за что, очевидно, и получила свое имя от латинского слова «flamma», что значит «пламя». Фламинго – житель тропиков и субтропиков, населяет у нас некоторые соленые озера Центрального Казахстана. Самая северная колония этой птицы расположена на озере Тенгиз в Кургальжинском заповеднике. Живет фламинго колониями от нескольких десятков до тысяч пар, которые устраивает на невысоких островках солоноватых озер. Гнезда их в виде башни до 60 см высотой и полуметра в диаметре строятся из земли прямо на открытом грунте. В небольшом углублении на вершине такого конуса откладывается от одного до трех грязно-белых яиц. В Казахстане фламинго бывают с апреля по сентябрь, зимуют они на южном побережье Каспия. Как очень редкая птица, фламинго занесен в Красную книгу Казахстана.

Сайга Saiga tatarica L.

В ХVII – ХVIII вв. этот вид населял все степи и пустыни Евразии от Карпат на западе до Монголии и Северного Китая на востоке. В начале ХХ в. численность его упала до нескольких сотен в разрозненных и малонаселенных районах от низовий Волги до западной Монголии. После специально принятых мер, численность выросла до миллиона особей к 60-70 гг. двадцатого столетия, а затем опять стала резко падать. В настоящее время Международным обществом охраны природы состояние этого вида определено как критическое, однако в нашей стране он не только не включен в Красную книгу, но и является охотничье-промысловым. 

Среднего размера (длина тела до 150 см, высота в холке до 80 см, масса до 50 кг) копытное животное. Окраска от желто-рыжей летом до глинисто-серой зимой. Необычна вздутая горбатая морда с нависающим надо ртом подвижным хоботком, на конце которого открывается круглые ноздри. Рога есть у самцов.
Стадное животное, совершающее широкие кочевки. В каждой группе у самца бывает несколько самок (от 4-6 до 15-20), которые приносят весной по 1-2 детеныша. Как только малыши немного окрепнут, стада продолжают свое движение к летним пастбищам. Питаются различными степными растениями, в конце лета, когда растительность высыхает, нуждаются в водопое. Зимой откочевывают в места с низким снеговым покровом. Половозрелыми самки становятся в полугодовалом возрасте. Это позволяет виду быстро восстанавливать свою численность. На вид влияют суровые зимы, большая плотность врагов – волков и лисиц, но главный враг этого уникального животного – браконьеры, использующие шкуру, мясо и рога, которые ценятся в тибетской медицине.